Serialul „Organizația” începe cu un eveniment deosebit de grav petrecut la o uzină militară din Ankara. După o investigație minuțioasă, autoritățile ajung la concluzia că explozia de la uzină nu a fost un accident, ci mai degrabă un act premeditat. Este clar că un grup de agenți străini a comis acest act terorist. Pentru a face față acestei amenințări grave, misiunea de a investiga și contracara acest atac este încredințată unei organizații de spionaj de stat.